In Alchemists concurreren twee tot vier beginnende alchemisten om de geheimen van hun mysterieuze kunst te ontdekken. Punten zijn op verschillende manieren te verdienen, maar de meeste punten krijg je door theorieën te publiceren – correcte theorieën welteverstaan — en daar schuilt het probleem.
Het spel wordt in zes ronden gespeeld. Aan het begin van de ronde kiezen spelers hun speelvolgorde. Wie ervoor kiest later te spelen krijgt meer beloningen.
Spelers verklaren al hun acties door kubussen op de verschillende actieruimtes te plaatsen, waarna elke actieruimte op volgorde wordt afgehandeld. Spelers verwerven kennis door ingrediënten te mengen en de resultaten te testen met een smartphone-app (iOS, Android en ook Windows) die de regels van de alchemie voor elk nieuw spel randomiseert. En als de alchemisten verlangen naar iets nog specialers, kunnen ze altijd magische artefacten kopen om een extra duwtje te geven. Er zijn er 9 (verschillend voor elk spel) en ze zijn niet alleen zeer krachtig, maar ook heel duur. Maar geld betekent niets wanneer er academische trots op het spel staat! En het bezit van deze artefacten zal je zeker ook wat reputatie opleveren. Spelers kunnen ook geld verdienen door drankjes van twijfelachtige kwaliteit aan avonturiers te verkopen, maar geld is slechts een middel tot een doel. De alchemisten willen tenslotte geen rijkdom. Ze willen respect, en respect komt meestal van het publiceren van theorieën.
Tijdens het spel stijgt en daalt de reputatie van spelers. Na zes ronden en een slotexpositie wordt reputatie omgezet in punten. Er worden ook punten gescoord voor artefacten en subsidies. Dan worden de geheimen van de alchemie onthuld en spelers scoren punten of verliezen punten afhankelijk van of hun theorieën correct bleken. Wie aan het einde van het spel de meeste punten heeft, wint.